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東京大学　先端科学技术研究センターの
がんの再発?転移治疗薬の开発用スーパーコンピュータシステムが稼働
世界初！分子动力学により抗体医薬品の基本构造の设计を実现

　このほど、東京大学 先端科学技术研究センター（所在:東京都目黒区、所長：中野 義昭、以下、先端研）と富士通株式会社（本社：東京都港区、代表取締役社長：山本 正已、以下、富士通）は共同で、がんの再発?転移治療薬の開発に活用するスーパーコンピュータシステムを構築し、2010年8月1日より稼働を開始させました。
　本システムは、富士通のブレードサーバ「PRIMERGY BX922 S2」によるPCクラスタ型のスーパーコンピュータです。300ノードで構成し、理論ピーク性能は38.3テラフロップス（注1）で、先端研におけるがんの再発?転移を治療する「ゲノム抗体医薬品」設計のためのコンピュータシミュレーションに活用されます。

 【「がんの再発?転移を治療する多機能な分子設計抗体の実用化」研究プロジェクトについて 】

　先端研 児玉龍彦 教授が中心となって推進する、最先端研究開発支援プログラム「がんの再発?転移を治療する多機能な分子設計抗体の実用化」のための研究開発では、ゲノム解読成果を基にしたがんの「ゲノム抗体医薬品」を、コンピュータシミュレーションを駆使することで世界に先駆けて設計し、臨床試験?治療を開始することを目指しています。
　抗体医薬品の研究开発世代には、1990年代からの动物実験により作った抗体医薬品をヒト型化し人间に适用できる抗体をつくる第一世代、2000年代からのがんに直接作用して放射线などによって治疗できる抗体をつくる第二世代があります。このたびの研究开発は、スーパーコンピュータによるシミュレーションを活用して抗体医薬品の基本构造の设计を行い、将来、日本で発生率の高いがん（肺、大肠、胃、肝臓、膵臓、前立腺、乳腺）や、再発?転移した进行性がんに対しても副作用の少ない画期的な第叁世代の抗体医薬品による治疗ができることを目的としています。
　この研究は、世界で初めて、がん细胞の一部である抗原（タンパク质）と抗体（タンパク质）との相互作用を分子动力学によりシミュレーションし、人工抗体の设计を行います。この手法は、滨罢创薬で一般的な、これまでのコンピュータを活用した低分子とタンパク质との相互作用のシミュレーションと比较して、约10倍と膨大な量の计算が必要となるため、短期间でシミュレーションを行えるスーパーコンピュータを导入しました。
　本システムの活用により、従来の実験による研究开発プロセスでは3～4年间かかっても実现が难しいとされていた人工抗体の设计を、わずか数ヶ月で行えることを目的としています。また将来は、この成果を元に、次世代スーパーコンピュータ(京速コンピュータ「京」)(注2)を活用して、さらに多くの抗体医薬品の开発を行うことを目指しています。



　　　抗原(オレンジ)と抗体(水色)のシミュレーション
 

【 スーパーコンピュータシステムの概要 】
　本スーパーコンピュータシステムは、最新のブレードサーバ「PRIMERGY BX922 S2」を計算ノードとした、300ノードからなるPCクラスタシステムです。最新のインテルXeonプロセッサー X5650をノードあたり2CPU、合計600CPU搭載し、理論ピーク性能は38.3テラフロップスです。ノード間の通信を行うインターコネクトには、4GB/sの転送性能を持つネットワークインターフェースであるInfiniBand QDRを採用しており、高性能な並列演算を実現しています。
　またストレージとして、ディスクアレイ装置「ETERNUS DX80」5台を備え、RAID6時の実効容量は1ペタバイトです。



　　　　　　　　スーパーコンピュータ

【商標について 】
インテル、Xeonは、米国およびその他の国における米国Intel Corporationの商標または登録商標です。
滨苍蹿颈苍颈叠补苍诲は、滨苍蹿颈苍颈叠补苍诲^SM Trade Associationの商標またはService Markです。
その他、记载されている商品名などの固有名词は、各社の商标または登録商标です。

【 注釈 】
(注1) テラフロップス（TFLOPS）：1テラフロップスは毎秒1兆回の浮動小数点演算速度。
(注2) 次世代スーパーコンピュータ : 文部科学省「革新的ハイパフォーマンス?コンピューティング?インフラの構築」計画のもと、富士通が理化学研究所と共同開発しているスカラ並列型スーパーコンピュータ。

《报道机関问い合わせ先》
東京大学　先端科学技术研究センター
経営戦略企画室広报担当　神野
 
富士通株式会社
広报滨搁室　足立
 
《お客様问い合わせ先》
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TCソリューション事業本部 TC統括営業部
电话：03-6252-2554(直通)
 
［贬笔颁ビジネス全般について］
富士通株式会社
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电话：03-6252-2483(直通)
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